環境と調和した持続的な農業を展開して国民に食の安全と安心を提供するとともに、農業環境資源を次世代へ継承することを目的に、農業環境に関する以下の研究を行う研究機関です。
　○農業生態系の持つ自然循環機能に基づいた食料と環境の安全性の確保
　○地球規模での環境変化と農業生態系との相互作用の解明
　○生態系・環境科学研究に係る基礎的・基盤的研究